Les chromosomes sont constitués d'Adn

Protocole Libmol

1) Utilisez le logiciel Libmol (logiciel de modélisation 3D de molécules)

Dans l'onglet "Fichiers", rechercher la molécule "ADN 14 paires de bases" dans la librairie de molécules
Aller dans "commandes", Sélectionner "tout", représenter en "squelette", colorer par "chaînes"
- - Indentifier le nombre de chaînes (ou brins) qui composent la molécule etobserver leur organisation spatiale. Puis schématiser la forme générale en 3D de cette molécule de manière simplifiée (légendes : chaine ou hélice A et chaine ou hélice B).

2) L'ADN est formée de différentes unités qui se répètent. Une unité de répétition de la molécule d’ADN s’appelle un NUCLÉOTIDE. On va changer la coloration de l'ADN pour colorer les nucléotides uniquement: choisir colorer par "résidus" puis tester les différentes représentations possibles dans la partie "représenter".

Identifier le nombre de nucléotides différents qui constituent la molécule d'ADN et nommez-les.

3) On appelle "séquence" l’enchaînement des nucléotides dans une chaîne (ou hélice) d’ADN. Aller dans "séquence"

Relever la séquence de la chaîne A affichée à l’écran et reporter la dans un tableau comme ci-dessous
Relever la séquence de la chaîne B affichée à l’écran et reporter la dans le tableau

4) Compte le nombre de chaque type de nucléotide présent dans la chaîne A, puis dans la chaîne B et reporte les dans le tableau (Exemple : combien il y a-t-il d’Adénosine dans la chaîne A ?). Que constatez-vous ?

5) En 1950 Chargaff découvre la « loi de complémentarité des nucléotides ». Cette loi indique que dans une molécule d’ADN les nucléotides qui se font face dans les deux chaînes opposées s’associent deux par deux de manière complémentaire.

A l’aide de vos tableaux et du logiciel Libmol déterminer quels sont les nucléotides qui s’associent ensemble.

Choisir Colorer par "résidus", "chaines latérales et squelette". Cela permet de visualiser :

→ En gris : chaînes invariables des nucléotides composées de sucres (désoxyribose) et phosphates.

→ En couleur : les bases azotées des nucléotides.

Identifier l’organisation spatiale des chaînes A et B (position respective latérale ou centrale des parties variables et invariables de la chaine)

6) Construire un modèle de la molécule d'ADN en imaginant que l’on déroule la molécule (c’est-à-dire que l’on supprime les torsades) avec les pièces mises à disposition. Recopier votre modèle sur votre compte rendu, en indiquant les légendes détaillées et un titre.

NB :

les bases azotées des nucléotides sont en couleur (ne pas tenir compte des couleurs)
les batonnets gris représentent les chaines invariables (sucres (désoxyribose) et phosphates).

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