lien non physique

entre gène et protéine

On veut étudier la correspondance gène/protéine à partir de l’exemple de la GFP. La GFP (green fluorescent protein) est une protéine constituée de 238 acides aminés. Elle est responsable de la fluorescence verte émise par certaines méduses de l'océan Pacifique.

Ce sont les acides aminés 65, 66 et 67 qui sont responsables de la fluorescence de la protéine.

La BFP (blue fluorescent protéin) est une protéine obtenue par les chercheurs à partir de la GFP. Elle émet une fluorescence bleue.

→ Pour comprendre l'origine de la différence de propriété de fluorescence (bleu ou vert), on peut comparer la séquence des acides aminés de ces protéines (BFP et GFP) et rechercher la nature de la relation entre ADN et protéine.

Comparer les protéines

comparer les gènes

Comparer les 2 protéines (GFP et BFP) avec le logiciel Libmol en ligne (utiliser la fiche méthode sur la page d'accueil)

Ouvrir 2 pages avec le logiciel Libmol
Taper le nom de la protéine à visualiser dans la librairie de molécules : GFP, puis BFP (dans chaque page) : visualiser la structure globale des 2 molécules
- Cliquer "Séquence” pour visualiser les acides aminés constituants la protéine et repérer les acides aminés 65, 66 et 67

NB : les acides aminés sont nommés par ses 3 premières lettres : pro pour proline, his pour histidine, etc...

Comparer les 2 gènes (GFP et BFP) avec le logiciel Geniegen en ligne (utiliser la fiche méthode sur la page d'accueil)

Télécharger les séquences “ADNGfpBfp”
Ouvrir dans le logiciel Geniegen (Fichier/charger des séquences /téléchargement/ADNGfpBfp)
Comparaison de l’ADN des 2 gènes : Action/Aligner des séquences
Si il y a une ou plusieurs différences entre les gènes, il faut préciser quelle est cette différence et quelle est sa position sur le gène

NB : seul un brin d'ADN sur les deux est représenté dans le logiciel et quand il y a un petit trait vertical rouge, cliquer dessus, et vous visualiserez les différences entre les 2 gènes : ce sont des mutations